Protege un importante ecosistema acuático en donde se pueden apreciar ríos, lagos y canales en una zona plana e inundable, formados por la cuenca del Río Chocón. Es un área importante como corredor biológico entre el Parque Nacional Río Dulce y el Área de Usos Múltiples Río Sarstún. Posee una gran cantidad de lagunas, ríos y riachuelos, los que le proporcionan características especiales de Selva Tropical Lluviosa, hábitat de gran diversidad biológica. Se encuentran aves como el rey zope (Sarcoramphus papa), mamíferos como la nutria (Lutra longicaudis) y variedad de reptiles y peces. El Biotopo fue creado originalmente para la conservación del manatí (Trichechus manatus).